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牛流行熱病毒(BEFV)核酸試劑盒引物設計的基本原則
日期:2025-06-16 00:05
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摘要:
牛流行熱病毒(BEFV)核酸試劑盒引物設計的基本原則:
1、 引物長度:15-30 bp,常用為20 bp左右。
2、 引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴增效果不佳,G+C 過多易出現非特異條帶。ATGC zui好隨機分布,避免5個以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。
3、 引物內部不應出現互補序列。
4、兩個引物之間不應存在互補序列,尤其是避免3 ′端的互補重疊。
5、引物與非特異擴增區的序列的同源性不要超過70%,引物3′末端連續8個堿基在待擴增區以外不能有完全互補序列,否則易導致非特異性擴增。
6、引物...
牛流行熱病毒(BEFV)核酸試劑盒引物設計的基本原則:
1、 引物長度:15-30 bp,常用為20 bp左右。
2、 引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴增效果不佳,G+C 過多易出現非特異條帶。ATGC zui好隨機分布,避免5個以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。
3、 引物內部不應出現互補序列。
4、兩個引物之間不應存在互補序列,尤其是避免3 ′端的互補重疊。
5、引物與非特異擴增區的序列的同源性不要超過70%,引物3′末端連續8個堿基在待擴增區以外不能有完全互補序列,否則易導致非特異性擴增。
6、引物3‘端的堿基,特別是zui 末及倒數第2個堿基,應嚴格要求配對,zui佳選擇是G和C。
7、 引物的5 ′端可以修飾。如附加限制酶位點,引入突變位點,用生物素、熒光物質、地高辛標記,加入其它短序列,包括起始密碼子、終止密碼子等。