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PCR反應主要要素引物分析
日期:2025-06-15 23:14
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摘要:
參加PCR反應的物質主要有五種即引物、酶、dNTP、模板和Mg2。
引物:引物是PCR特異性反應的關鍵,PCR 產物的特異性取決于引物與模板DNA互補的程度。理論上,只要知道任何一段模板DNA序列, 就能按其設計互補的寡核苷酸鏈做引物,利用PCR就可將模板DNA在體外大量擴增。設計引物應遵循以下原則:
1、引物長度: 15-30bp,常用為20bp左右。
2、引物擴增跨度: 以200-500bp為宜,特定條件下可擴增長至10kb的片段。
3、引物堿基:G C含量以40-60%為宜,G C太少擴增效果不佳,G C過多易出現非特異條帶。ATGC...
參加PCR反應的物質主要有五種即引物、酶、dNTP、模板和Mg2。
引物:引物是PCR特異性反應的關鍵,PCR 產物的特異性取決于引物與模板DNA互補的程度。理論上,只要知道任何一段模板DNA序列, 就能按其設計互補的寡核苷酸鏈做引物,利用PCR就可將模板DNA在體外大量擴增。設計引物應遵循以下原則:
1、引物長度: 15-30bp,常用為20bp左右。
2、引物擴增跨度: 以200-500bp為宜,特定條件下可擴增長至10kb的片段。
3、引物堿基:G C含量以40-60%為宜,G C太少擴增效果不佳,G C過多易出現非特異條帶。ATGC隨機分布,避免5個以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。
4、避免引物內部出現二級結構,避免兩條引物間互補,特別是3'端的互補,否則會形成引物二聚體,產生非特異的擴增條帶。
5、引物3'端的堿基,特別是末及倒數第2個堿基,應嚴格要求配對,以避免因末端堿基不配對而導致PCR失敗。
6、引物中有或能加上合適的酶切位點, 被擴增的靶序列有適宜的酶切位點, 這對酶切分析或分子克隆很有好處。
7、引物的特異性:引物應與核酸序列數據庫的其它序列無明顯同源性。